Pipeline (kadi.kidas.pipeline)¶
Pipeline est l'orchestrateur central du module kidas. Il enchaîne les étapes
de nettoyage, validation et normalisation de manière déclarative, détecte
automatiquement le type de source depuis le chemin ou l'URL, et gère la mise
en cache des résultats via SQLite.
Son API est fluide : chaque méthode retourne l'instance courante, ce qui permet d'enchaîner les appels sans variable intermédiaire.
Initialisation¶
Pipeline s'initialise sans argument. La source et les étapes sont configurées
par méthodes chaînées.
Méthodes de configuration¶
add_source(source, **kwargs)¶
Configure la source de données du pipeline. Détecte automatiquement le type de source depuis l'extension du fichier ou le préfixe de l'URL.
pipeline.add_source("recoltes_2024.csv")
pipeline.add_source("rapport.xlsx", sheet="Parakou")
pipeline.add_source("https://api.data.bj/agriculture/prices")
Il est également possible de passer directement une instance Source :
from kadi.io import CSVSource
source = CSVSource("recoltes.csv", sep=";", encoding="latin-1")
pipeline.add_source(source)
| Paramètre | Type | Description |
|---|---|---|
source |
str ou Source |
Chemin, URL ou instance Source |
**kwargs |
- | Arguments transmis au constructeur de la classe Source |
Retour : Pipeline (pour le chaînage).
Alias court : load(source, **kwargs)
add_step(step_name, schema_or_mappings=None, **params)¶
Ajoute une étape de traitement à la file du pipeline. Le type de l'étape (nettoyage, validation ou normalisation) est déterminé automatiquement selon le nom passé.
pipeline.add_step("drop_dupes")
pipeline.add_step("fill_missing", strategy="median")
pipeline.add_step("check_schema", {"culture": "str", "rendement_kg": "float"})
pipeline.add_step("norm_cols", {"crops": "culture"})
Étapes de nettoyage disponibles¶
| Nom | Description |
|---|---|
'drop_dupes' |
Supprime les lignes dupliquées |
'fill_missing' |
Impute les valeurs manquantes (paramètre strategy) |
'drop_outliers' |
Supprime les valeurs aberrantes (paramètres method, threshold) |
'parse_dates' |
Normalise les colonnes de dates vers datetime64 |
'norm_text' |
Normalise les chaînes de caractères (accents, casse, espaces) |
'strip_chars' |
Supprime les caractères spéciaux indésirables |
Étapes de validation disponibles¶
| Nom | Description |
|---|---|
'check_schema' |
Vérifie les types de colonnes selon un schéma dict |
'check_types' |
Valide les types de données colonne par colonne |
'check_ranges' |
Contrôle que les valeurs numériques sont dans des plages définies |
'check_coords' |
Valide que les coordonnées GPS sont dans les limites du Bénin |
'check_unique' |
Vérifie l'unicité des valeurs dans les colonnes spécifiées |
'check_fk' |
Contrôle les contraintes de clé étrangère entre colonnes |
Étapes de normalisation disponibles¶
| Nom | Description |
|---|---|
'norm_cols' |
Renomme les colonnes selon un dictionnaire de correspondances |
'convert_units' |
Convertit les unités (kg/tonne, ha/m2, etc.) |
'convert_currency' |
Convertit les devises via ExchangeRateClient |
'std_crops' |
Normalise les noms de cultures vers le référentiel KadiPy |
'std_markets' |
Normalise les noms de marchés |
'std_coords' |
Normalise les coordonnées GPS (format, arrondi) |
Alias courts :
clean(step, **params): alias pour les étapes de nettoyagevalidate(schema, **params): alias pouradd_step('check_schema', schema)normalize(mappings, **params): alias pouradd_step('norm_cols', mappings)
Exécution¶
run(cache=True)¶
Exécute toutes les étapes configurées dans l'ordre. Charge les données depuis la source, applique chaque étape, met le résultat en cache si demandé.
| Paramètre | Type | Défaut | Description |
|---|---|---|---|
cache |
bool |
True |
Tente un chargement depuis le cache avant la lecture, et sauvegarde le résultat après traitement |
Retour : tuple[pd.DataFrame, dict]
Exceptions :
PipelineError: si aucune source n'a été configurée.ReadError: si la lecture de la source échoue.
Structure du rapport retourné¶
df, rapport = pipeline.run()
rapport["nb_rows_in"] # int : lignes brutes chargées
rapport["nb_rows_out"] # int : lignes après traitement
rapport["steps_summary"] # list : noms des étapes dans l'ordre
rapport["quality_score"] # dict | None : score qualité (si validation)
rapport["warnings"] # list : avertissements de validation
rapport["cache_utilise"] # bool : True si données issues du cache
rapport["details"] # dict : rapports internes de chaque étape
Le quality_score est un dict produit par Validator. Il est None si aucune
étape de validation n'a été configurée.
Méthodes utilitaires¶
config()¶
Retourne la configuration complète du pipeline : source configurée et liste des étapes définies.
cfg = pipeline.config()
print(f"Nombre d'étapes : {cfg['nb_steps']}")
for etape in cfg["steps"]:
print(f" {etape['type']} : {etape['nom']} ({etape['params']})")
Retour : dict avec les clés source, nb_steps, steps.
export(filepath)¶
Exporte le rapport interne du pipeline dans un fichier JSON ou HTML selon l'extension du chemin de destination.
| Extension | Format |
|---|---|
.json |
JSON indenté, encodé en UTF-8 |
.html |
Page HTML simple avec le JSON pré-formaté |
Retour : True si l'export réussit.
Exception : PipelineError si l'extension n'est pas supportée.
Exemples complets¶
Pipeline minimal¶
from kadi.kidas import Pipeline
df, rapport = (
Pipeline()
.add_source("recoltes_2024.csv")
.add_step("drop_dupes")
.add_step("fill_missing", strategy="median")
.run()
)
print(f"{rapport['nb_rows_in']} -> {rapport['nb_rows_out']} lignes")
Pipeline avec validation et normalisation¶
from kadi.kidas import Pipeline
df, rapport = (
Pipeline()
.add_source("enquete_prix_2024.xlsx")
.add_step("drop_dupes")
.add_step("fill_missing", strategy="median")
.add_step("drop_outliers", method="iqr")
.add_step("check_schema", {
"culture": "str",
"marche": "str",
"prix_xof_kg": "float",
"date": "datetime",
})
.add_step("std_crops", col="culture")
.add_step("norm_cols", {"prix_xof_kg": "price_xof"})
.run(cache=True)
)
if rapport.get("quality_score"):
print(f"Score qualité : {rapport['quality_score']['overall']:.2f}")
for avertissement in rapport.get("warnings", []):
print(avertissement)
API fluide avec les alias courts¶
from kadi.kidas import Pipeline
df, rapport = (
Pipeline()
.load("prix_2024.csv")
.clean("drop_dupes")
.clean("fill_missing", strategy="median")
.validate({"culture": "str", "prix_xof_kg": "float"})
.normalize({"crops": "culture"})
.run(cache=True)
)
Réutilisation d'une source existante¶
from kadi.io import CSVSource
from kadi.kidas import Pipeline
source = CSVSource("export_maep.csv", sep=";", encoding="latin-1")
df, rapport = (
Pipeline()
.add_source(source)
.add_step("drop_dupes")
.add_step("parse_dates", cols=["date_recolte"])
.run()
)
Export du rapport¶
pipeline = Pipeline()
df, rapport = (
pipeline
.add_source("donnees.csv")
.add_step("check_schema", {"culture": "str"})
.run()
)
pipeline.export("rapport.json")
Comportement du cache¶
Le pipeline utilise un cache SQLite interne (géré par Cache). La clé de
cache est calculée par hachage SHA-256 du chemin de la source, tronqué à
16 caractères hexadécimaux.
Lorsque cache=True :
- Le pipeline cherche une entrée existante dans le cache.
- Si elle existe, les données sont retournées directement sans relire la source ni ré-exécuter les étapes.
- Si elle n'existe pas, le pipeline exécute toutes les étapes et sauvegarde le résultat.
Le rapport indique si les données proviennent du cache via la clé cache_utilise.
Pour forcer une ré-exécution complète sans utiliser le cache :
Rétrocompatibilité¶
Les anciens noms de méthodes émettent un DeprecationWarning et continuent
de fonctionner jusqu'à KadiPy v2.0 :
| Ancien nom (avant v1.2.0) | Nouveau nom |
|---|---|
load_data(source) |
add_source(source) ou load(source) |
add_cleaning_step(step) |
add_step(step) ou clean(step) |
add_validation_step(schema) |
add_step('check_schema', schema) ou validate(schema) |
add_normalization_step(mappings) |
add_step('norm_cols', mappings) ou normalize(mappings) |
execute(cache) |
run(cache) |
get_pipeline_config() |
config() |
export_report(filepath) |
export(filepath) |
Pipeline ¶
Orchestrateur du flux de traitement de données agricoles kidas.
Pipeline est le point d'entrée unique pour les utilisateurs de kidas. Il permet de définir de manière déclarative et chainable un flux complet : chargement → nettoyage → validation → normalisation → cache.
L'auto-détection du type de source (CSV, Excel, JSON, NetCDF, API) est basée sur l'extension du fichier ou le préfixe 'http' de l'URL.
Attributs
_source (Source | None): Source de données configurée. _df (pd.DataFrame | None): Données courantes dans le pipeline. _steps (list): Liste ordonnée des étapes de traitement configurées. _reports (dict): Rapports agrégés de toutes les étapes. _cache (Cache): Instance du gestionnaire de cache kidas.
Exemple
pipeline = Pipeline() df, rapport = ( ... pipeline ... .add_source('recolte_2024.xlsx') ... .add_step('drop_dupes') ... .add_step('fill_missing', strategy='mean') ... .add_step('check_schema', {'culture': 'str', 'rendement_kg': 'float'}) ... .run(cache=True) ... ) print(rapport['nb_rows_out']) 150 print(rapport['quality_score']['overall']) 0.97
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 480 481 482 483 484 485 486 487 488 489 490 491 492 493 494 495 496 497 498 499 500 501 502 503 504 505 506 507 508 509 510 511 512 513 514 515 516 517 518 519 520 521 522 523 524 525 526 527 528 529 530 531 532 533 534 535 536 537 538 539 540 541 542 543 544 545 546 547 548 549 550 551 552 553 554 555 556 557 558 559 560 561 562 563 564 565 566 567 568 569 570 571 572 573 574 575 576 577 578 579 580 581 582 583 584 585 586 587 588 589 590 591 592 593 594 595 596 597 598 599 600 601 602 603 604 605 606 607 608 609 610 611 612 613 614 615 616 617 618 619 620 621 622 623 624 625 626 627 628 629 630 631 632 633 634 635 636 637 638 639 640 641 642 643 644 645 646 647 648 649 650 651 652 653 654 655 656 657 658 659 660 661 662 663 664 665 666 667 668 669 670 671 672 673 674 675 676 677 678 679 680 681 682 683 684 685 686 687 688 689 690 691 692 693 694 695 696 697 698 699 700 701 702 703 704 705 706 707 708 709 710 711 712 713 714 715 716 717 718 719 720 721 722 723 724 725 726 727 728 729 730 731 732 733 734 735 736 737 738 739 740 741 742 743 744 745 746 747 748 749 750 751 752 753 754 755 756 757 758 759 760 761 762 763 764 765 766 767 768 769 770 771 772 773 774 775 776 777 778 779 780 781 782 783 784 785 786 787 788 | |
__init__ ¶
Initialise un pipeline vide prêt à recevoir des étapes de traitement.
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
add_source ¶
Configure la source de données du pipeline.
Auto-détecte le type de source si un chemin de fichier est fourni, ou utilise directement une instance Source existante.
Parameters:
| Name | Type | Description | Default |
|---|---|---|---|
source
|
str | PathLike | Source
|
Chemin vers le fichier, URL de l'API, ou instance Source directement. |
required |
**kwargs
|
Any
|
Arguments optionnels transmis au constructeur de la Source (ex: encoding, sheet_name, use_dask). |
{}
|
Returns:
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
Pipeline |
Pipeline
|
L'instance courante (pour le chaînage). |
Raises:
| Type | Description |
|---|---|
PipelineError
|
Si le type de source est indéterminable. |
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
add_step ¶
Ajoute une étape de traitement à la file du pipeline.
Accepte des étapes de nettoyage, de validation ou de normalisation en un seul point d'entrée. Le type de l'étape est déterminé automatiquement selon le nom passé.
Parameters:
| Name | Type | Description | Default |
|---|---|---|---|
step_name
|
str
|
Nom de l'étape. Valeurs acceptées : - Nettoyage : 'drop_dupes', 'fill_missing', 'drop_outliers', 'parse_dates', 'norm_text', 'strip_chars'. - Validation : 'check_schema', 'check_types', 'check_ranges', 'check_coords', 'check_unique', 'check_fk'. - Normalisation : 'norm_cols', 'convert_units', 'convert_currency', 'std_crops', 'std_markets', 'std_coords'. |
required |
schema_or_mappings
|
Any
|
Argument positionnel optionnel pour les étapes de validation (schema dict) ou normalisation (mappings dict). |
None
|
**params
|
Any
|
Paramètres supplémentaires à passer à la méthode (ex: strategy='mean', cols=['id', 'date']). |
{}
|
Returns:
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
Pipeline |
Pipeline
|
L'instance courante (pour le chaînage). |
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 | |
load ¶
Configure la source de données du pipeline (alias court de add_source).
Parameters:
| Name | Type | Description | Default |
|---|---|---|---|
source
|
str | Source
|
Chemin vers le fichier, URL ou instance Source. |
required |
**kwargs
|
Any
|
Arguments transmis au constructeur de la Source. |
{}
|
Returns:
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
Pipeline |
Pipeline
|
L'instance courante pour le chaînage. |
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
clean ¶
Ajoute une étape de nettoyage au pipeline (alias court de add_step).
Parameters:
| Name | Type | Description | Default |
|---|---|---|---|
step
|
str
|
Nom de l'étape de nettoyage (ex: 'drop_dupes'). |
required |
**params
|
Any
|
Paramètres de l'étape de nettoyage. |
{}
|
Returns:
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
Pipeline |
Pipeline
|
L'instance courante pour le chaînage. |
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
validate ¶
Ajoute une étape de validation au pipeline (alias court de add_step).
Parameters:
| Name | Type | Description | Default |
|---|---|---|---|
schema
|
dict | str
|
Schéma de validation ou nom de l'étape. |
None
|
**params
|
Any
|
Paramètres de validation. |
{}
|
Returns:
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
Pipeline |
Pipeline
|
L'instance courante pour le chaînage. |
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
normalize ¶
Ajoute une étape de normalisation au pipeline (alias court de add_step).
Parameters:
| Name | Type | Description | Default |
|---|---|---|---|
mappings
|
dict | str
|
Mappings de normalisation ou nom de l'étape. |
None
|
**params
|
Any
|
Paramètres de normalisation. |
{}
|
Returns:
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
Pipeline |
Pipeline
|
L'instance courante pour le chaînage. |
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
run ¶
Exécute toutes les étapes configurées du pipeline.
Charge les données depuis la source, applique les étapes de nettoyage, validation et normalisation dans l'ordre, puis met le résultat en cache si demandé.
Parameters:
| Name | Type | Description | Default |
|---|---|---|---|
cache
|
bool
|
Si True, tente de charger depuis le cache avant la lecture et sauvegarde le résultat final. Par défaut True. |
True
|
Returns:
| Type | Description |
|---|---|
Tuple[DataFrame, Dict]
|
tuple[pd.DataFrame, dict]: Tuple contenant :
- Le DataFrame traité et prêt à l'emploi.
- Le rapport structuré selon la documentation :
- |
Raises:
| Type | Description |
|---|---|
PipelineError
|
Si aucune source n'a été configurée. |
ReadError
|
Si la lecture de la source échoue. |
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 | |
config ¶
Retourne la configuration complète du pipeline (étapes définies).
Returns:
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
dict |
dict
|
Dictionnaire décrivant la source et les étapes configurées. |
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
export ¶
Exporte le rapport de pipeline dans un fichier JSON ou HTML.
Parameters:
| Name | Type | Description | Default |
|---|---|---|---|
filepath
|
str
|
Chemin de destination du rapport. L'extension détermine le format : '.json' ou '.html'. |
required |
Returns:
| Name | Type | Description |
|---|---|---|
bool |
bool
|
True si l'export s'est déroulé avec succès. |
Raises:
| Type | Description |
|---|---|
PipelineError
|
Si l'extension n'est pas supportée. |
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
load_data ¶
Alias de rétrocompatibilité pour add_source().
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
add_cleaning_step ¶
Alias de rétrocompatibilité pour add_step().
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
add_validation_step ¶
Alias de rétrocompatibilité pour add_step('check_schema', schema).
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
add_normalization_step ¶
Alias de rétrocompatibilité pour add_step('mappings', mappings).
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
execute ¶
Alias de rétrocompatibilité pour run().
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
get_pipeline_config ¶
Alias de rétrocompatibilité pour config().
Source code in kadi/kidas/pipeline.py
export_report ¶
Alias de rétrocompatibilité pour export().